二期工程建于医院现有院区，由北京市出资建设，总建筑面积15.6万平方米。当前，北京清华长庚医院构建了涵盖“智慧医疗、智慧服务、智慧管理、智慧科研、智慧教学、智慧健联体”六大版块的智慧医院。随着二期工程投入使用，医院面向临床一线全面建设智慧医疗，覆盖医院门诊、急诊、手术室、病房、平台科室等医疗全流程。
（撰稿：皇甫娟慧）
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